Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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CLN3Q13286 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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