Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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NME3Q13232 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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NME3Q13232 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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NME3Q13232 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME3Q13232 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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NME3Q13232 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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