Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms