Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms