Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IFITM3Q01628 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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