Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms