Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSEN2P49810 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSEN2P49810 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms