Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK8P49336 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK8P49336 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK8P49336 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK8P49336 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK8P49336 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK8P49336 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK8P49336 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK8P49336 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK8P49336 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK8P49336 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK8P49336 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK8P49336 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK8P49336 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK8P49336 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK8P49336 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK8P49336 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK8P49336 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK8P49336 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK8P49336 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK8P49336 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK8P49336 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK8P49336 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK8P49336 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK8P49336 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK8P49336 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK8P49336 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK8P49336 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK8P49336 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK8P49336 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK8P49336 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK8P49336 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK8P49336 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK8P49336 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK8P49336 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK8P49336 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK8P49336 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms