Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCAMP43121 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCAMP43121 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCAMP43121 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms