Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MLH1P40692 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms