Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms