Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPB2P35606 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
COPB2P35606 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
COPB2P35606 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COPB2P35606 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COPB2P35606 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COPB2P35606 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPB2P35606 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPB2P35606 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPB2P35606 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPB2P35606 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPB2P35606 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPB2P35606 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPB2P35606 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPB2P35606 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPB2P35606 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPB2P35606 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPB2P35606 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPB2P35606 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPB2P35606 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPB2P35606 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms