Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms