Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLD1P28340 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLD1P28340 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLD1P28340 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLD1P28340 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLD1P28340 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms