Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PLNP26678 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms