Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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