Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB1P16220 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB1P16220 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms