Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms