Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR5O60602 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLR5O60602 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLR5O60602 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLR5O60602 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLR5O60602 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLR5O60602 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLR5O60602 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLR5O60602 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLR5O60602 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR5O60602 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms