Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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HOXA3O43365 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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HOXA3O43365 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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HOXA3O43365 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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HOXA3O43365 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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HOXA3O43365 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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HOXA3O43365 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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HOXA3O43365 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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HOXA3O43365 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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