Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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