Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms