Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms