Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms