Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF3Q9ULT6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms