Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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