Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms