Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP4F12Q9HCS2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms