Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms