Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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