Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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