Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM54Q9BYV2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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