Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms