Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms