Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 MYCNOS-202ENST00000641263 1313 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms