Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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MMP19Q99542 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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MMP19Q99542 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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MMP19Q99542 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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MMP19Q99542 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MMP19Q99542 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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