Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPZA3Q96KX2 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms