Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms