Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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UBA3Q8TBC4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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