Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms