Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM187BQ17R55 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM187BQ17R55 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms