Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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