Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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FXNQ16595 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FXNQ16595 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FXNQ16595 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FXNQ16595 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FXNQ16595 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FXNQ16595 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FXNQ16595 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FXNQ16595 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FXNQ16595 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FXNQ16595 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FXNQ16595 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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FXNQ16595 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FXNQ16595 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FXNQ16595 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FXNQ16595 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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FXNQ16595 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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FXNQ16595 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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FXNQ16595 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FXNQ16595 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FXNQ16595 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FXNQ16595 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FXNQ16595 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FXNQ16595 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FXNQ16595 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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FXNQ16595 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FXNQ16595 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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