Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED1Q15648 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED1Q15648 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MED1Q15648 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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