Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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RAB35Q15286 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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RAB35Q15286 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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RAB35Q15286 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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RAB35Q15286 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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RAB35Q15286 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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RAB35Q15286 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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RAB35Q15286 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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RAB35Q15286 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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