Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms