Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF1Q14162 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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