Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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GTF2H3Q13889 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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GTF2H3Q13889 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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GTF2H3Q13889 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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GTF2H3Q13889 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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GTF2H3Q13889 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H3Q13889 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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GTF2H3Q13889 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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GTF2H3Q13889 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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GTF2H3Q13889 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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GTF2H3Q13889 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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GTF2H3Q13889 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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GTF2H3Q13889 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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GTF2H3Q13889 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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