Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms