Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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